药物流产虽然减轻了女性患者的痛苦，有一定的优点，但是不可否认的是，这种流产方式还是不很完善的，相比无痛人流来说，有着很多的缺点。临床使用药物流产的女性患者，也有很多出现了一些危害。

　　1、成功率比较低：应用于药流中的米非司酮这种药物的诞生才短短的十几年时间，临床的试验还不够充分。所以药物流产的成功率仅为75%左右，剩下的一部分患者会发生药流不全等症状，需要进行清宫术，带来不必要的一些痛苦。

　　2、造成不孕：药流其实是很易导致患者输卵管发生堵塞，宫颈的粘连的，从而造成了继发性的不孕;药流如果不干净，清宫的手术进行不当，也有可能会造成女性的不孕;另外，药流对女子的子宫和卵巢的伤害是特别大的，因此也是临床造成不孕的原因之一。

　　3、引发炎症：由于药流后患者的子宫腔内的胚囊组织可能会在当天排出，不过有时妊娠组织物会排出不全，子宫膜的复旧就会欠佳，阴道的出血时间就会较长，有的可持续2-3周，甚至部分患者1-2个月。长期的慢性失血可能会引起缺铁性贫血，使身体的抵抗力逐渐下降。细菌往往就会由阴道逆行，引起子宫内膜等部位的炎症。